第四范式生物藥物計算成果再次登上《Nature》子刊
        2023-12-21
        1220日晚,國際頂級學術期刊《Nature》旗下子刊《Nature Computational Science》發表了第四范式(第一完成單位)在生物計算領域最新的研究成果該論文采用了人工智能與生物網絡相結合的方法,精準預測聯合用藥后在療效、耐藥性、不良反應等方面的表現,可為臨床治療和新型藥物研發提供重要科學依據。這也是Nature》系列期刊第二次刊登第四范式相關研究成果。


        論文地址:https://www.nature.com/articles/s43588-023-00558-4

        《Nature Computational Science》是專注于基礎和應用計算科學的《Nature》期刊側重于計算技術和數學模型的開發與使用,以解決一系列科學學科中的復雜問題。該期刊以收錄論文“量少質高”著稱,發表的論文極具科研及應用價值。

        聯合用藥是臨床最普遍且有效的治療方式之一,具有增強療效、減少毒副作用和縮短療程等優點,但同時也伴隨著藥物相互作用引起的不良反應等不確定性因素。因此,多重用藥副作用的預測和發現,對改善患者用藥護理和新型藥物研發均起著至關重要的作用。

        為了提升新型藥物相互作用的推理效果,第四范式提出利用生物網絡進行知識補全。生物網絡是一種有向多關系圖,包含諸如基因、疾病、藥物等生物網絡的豐富生物知識,可以為新藥提供有效的輔助信息。此外,為解決生物網絡中大量無聲、噪音問題,第四范式利用基于路徑子圖的注意力機制,挖掘聯通新藥和已知藥物的重要鏈接路徑,從而實現對新型藥物相互作用的有效推理。

        相比傳統基于特征的藥物作用推理和基于深度學習的預測算法,利用生物網絡的EmerGNN算法對于各類型的藥物作用預測均能起到約10%的準確率提升,同時可通過挖掘出的路徑起到解釋預測結果的作用。

        除此之外,該成果還可被廣泛應用到其他生物醫藥領域,例如藥物靶向預測、蛋白質相互作用預測等。



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